01
导入 GFF / GTF 注释文件
支持 .gff .gff3 .gtf 及 .gz 压缩包。文件仅在本机浏览器与本地 Python 进程之间传输,不会上传到任何服务器。
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单个文件最大 800 MB;压缩包会自动解压
GFF3GTFGFF2
解析设置 默认值适用于绝大多数 GFF3 文件
解析设置已修改,重新导入文件后生效。
02
解析结果
—
基因数
0
features
染色体数
0
sequences
基因组总长
0
bp
解析耗时
0
ms
基因清单筛选
每行一个基因 ID 或名称,也支持逗号 / 分号分隔;自动去重,匹配不区分大小写。未启用清单筛选,当前显示全部基因。
| # | 基因 ID | 名称 | 染色体 | 起始 | 终止 | 长度 | 链 | 标记颜色 |
|---|
长度来源优先级:
##sequence-region 声明 → region / chromosome 特征长度 → 注释中最大终止坐标。
表格中的长度可直接修改,修改值会同步到 MG2C 的 input2,并参与越界校验。
| 染色体 | 长度(bp) | 约合 | 来源 | 基因数 | 最左基因 | 最右基因 |
|---|
03
生成 MG2C 出图数据
按 MG2C 官方要求生成 TAB 分隔的 input1(基因位置,含颜色)与 input2(染色体长度),复制后直接粘贴到网站文本框即可绘图。
配色方案
所有基因使用同一标记色
正链(+)
负链(−)
每条染色体自动分配一种颜色,可单独调整;基因颜色跟随所在染色体。
输入基因 ID 或名称中的关键词,命中者使用高亮色,其余使用基础色。
高亮色
基础色
以上规则作用于全部基因;清单中逐个设置的颜色优先于这里的方案。
输出设置
MG2C 版本格式
input1 导出范围(基因)
清单基因配色
在步骤 02 应用基因清单后,可在这里为每个基因单独指定颜色。
格式提示
第 5 列支持十六进制颜色(如
#00dd00)或英文色名;字段之间必须是 TAB;基因 ID 不能含空格;染色体长度应不小于该染色体上基因的最大终止坐标。